用户在使用次氯酸钠发生器的过程中可能会遇到一些难以解决的问题，其中比较棘手的为题就是次氯酸钠发生器的杀菌消毒效果没有达到预期的效果，次氯酸钠溶液并没有杀死水中的有害微生物和病毒细菌。而造成该问题出现的主要原因如下：
1.水质的PH值
使用次氯酸钠发生器制取次氯酸钠溶液，再利用次氯酸钠溶液进行杀菌消毒时一定要控制预处理水质的PH值。如果要处理的污水的PH值过高就会影响次氯酸钠溶液的消毒杀菌效果。理想的杀菌环境是水质呈现弱碱性，在这样的环境下的杀菌效果比呈现酸性的水质更好。
2.浓度
浓度是影响次氯酸钠发生器杀菌效果的主要因素之一，如果用户投加的次氯酸钠溶液达不到设计要求的浓度，就回导致次氯酸钠发生器的使用效果不理想，达不到预期的杀菌效果。
3.温度
利用次氯酸钠发生器对自来水或污水进行处理时要考虑温度带来的影响，水温应该控制在一定的范围之内，这样才能够保证理想的杀菌效果。过高或者过低的水温都可能导致杀菌效果不理想或者根本没有杀菌效果。
4.有机物
污水中含有大量的有机物，这些有机物在使用次氯酸钠溶液这样的含氯消毒剂时会快速消耗有效氯，从而影响最终的处理结果。而针对这样的污水我们建议提高投加量，增大次氯酸钠溶液的浓度，这有这样才能够达到理想的杀菌效果。
5.污水中含有大量的硫化物
硫化物会与次氯酸钠溶液出现化学反应，从而降低次氯酸钠溶液的杀菌效果，而在日常的污水处理过程中如果污水中含有大量的硫化物则应该先进行脱硫预处理，这样才能够保证理想的杀菌效果。
影响次氯酸钠发生器的杀菌效果除了以上几点之外，还有其他很多因素会影响最终的杀菌消毒效果，例如污水中含有大量的氨化物等，这些都应该在安装设备之前进行污水样本检测，根据检测的结果选择合适的污水处理的设备，从而达到理想的杀菌消毒效果。
